Генетика мобильных элементов
Руководитель: профессор, д.б.н. Ким Александр Иннокентьевич
коллектив:
-
профессор, д.б.н. Ким Александр Иннокентьевич
-
профессор, д.б.н. Нефедова Лидия Николаевна
-
доцент, к.б.н. Романова Наталия Ивановна
-
доцент, к.б.н. Кузьмин Илья Владимирович
-
научный сотрудник Лавренов Антон Русланович
-
младший научный сотрудник Кукушкина Инна Владимирова
-
Инженер-лаборант Миляева Полина Андреевна
-
Лаборант Дьяченко Анна Игоревна
-
Лаборант Фролова Арина Александровна
ОПИСАНИЕ НАПРАВЛЕНИЯ
Основными направлениями являются исследования генетического контроля транспозиции мобильного элемента и ретровируса gypsy и родственных ему элементов; структуры и функции отдельных районов мобильного элемента gypsy; эволюции мобильных элементов группы gypsy; процессов молекулярной доместикации последовательностей ретровирусов и мобильных элементов.
За последние годы в группе проведены исследования по изучению молекулярно-генетических механизмов функционирования гена flamenco дрозофилы, осуществляющего генетический контроль перемещений gypsy у D. melanogaster. Исследована экспрессия локуса flamenco. Исследованы доместицированные гены ретровирусов gag и env в геноме D. melanogaster. Проведен эволюционный анализ последовательностей доместицированных генов gag и env в геномах разных видов дрозофилы. Выявлен и функционально исследуется гомолог гене gag – Gagr.
Группа располагает широким арсеналом современных методов научного исследования. В экспериментальной работе применяются генетический анализ, генно-инженерные методы, обратная транскрипция и ПЦР-анализ в реальном времени, секвенирование геномов, гибридизация нуклеиновых кислот (саузерн, нозерн), методы экспрессии генов на уровне транскрипции и трансляции, выделение, фракционирование и гибридизация белков (вестерн), иммуноферментный анализ, получение трансгенных линий дрозофилы. Помимо этого ведется биоинформатический анализ.
Возможные темы выпускных работ бакалавра и магистра:
- Исследование генетического контроля транспозиций мобильных элементов (ретроэлементов)
- Исследование структуры и функции доместицированных генов ретроэлементов в хозяйском геноме
- Дрозофила как модель наследственных заболеваний человека
- Исследование метаболизма витамина К на модельном объекте D. melanogaster